L'organisation actuelle de l'agence est constituée d'une Direction générale assistée par un comité consultatif (Direction d'Assistance aux collectivités locales, direction des études et des recherches, direction de la gestion des informations urbaines, Direction des services communs et la direction de la coopération et de la formation et la diffusion).

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Les entités dans ce comité sont le MEHAT (Ministère de l'Equipement, de l'Habitat et de l'Aménagement du territoire), le Ministère des Collectivités Locales et de l'Environnement, le Ministère de l'Agriculture, le Ministère du Tourisme, le ministère de l'Industrie, le secrétariat d'État des domaines de l'État.